tmb-msi-calculator
Tumor mutation burden and microsatellite instability calculation skill for immunotherapy biomarkers
它会碰到什么
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它会碰到什么不碰外部（只输出文字）
命中总数0 处
命中统计严重 0 · 高 0 · 中 0 · 低 0
这一栏是扫描器报的事实，不是结论。命中多不等于有毒（安全工具、规则库、示例脚本本来就会包含危险写法），命中少也不等于干净。它和你手上的凭据、文件、网络有什么关系，需要你自己看。
技能内容
TMB-MSI Calculator Skill
Purpose
Calculate tumor mutation burden and microsatellite instability for immunotherapy biomarker assessment.
Capabilities
- TMB calculation from VCF
- MSI status determination
- Neoantigen prediction
- HLA typing integration
- Biomarker thresholds
- Clinical report generation
Usage Guidelines
- Calculate TMB with appropriate normalization
- Determine MSI status accurately
- Predict neoantigens for immunotherapy
- Apply clinical thresholds for reporting
- Generate actionable reports
- Document methodology and thresholds
Dependencies
- TMBcat
- MSIsensor2
- MANTIS
Process Integration
- Tumor Molecular Profiling (tumor-molecular-profiling)
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它属于哪个仓库
星标★ 1,796
本站分层T1
该仓技能数2115
原文件路径
library/specializations/domains/science/bioinformatics/skills/tmb-msi-calculator/SKILL.md